¿Los análisis de heces para estudiar la microbiota y los test de metabolitos orgánicos son fiables

No. En general los estudios sobre microbiota en están en fase de desarrollo. Disbiosis es un término ambiguo que requiere en primera instancia definir qué es "biosis" (flora intestinal normal) para poder decir qué se entiende por "disbiosis" (supuestamente, alteración de la flora normal, desequilibrio de la misma). Si no sabemos cuál es el equilibrio... es un poco arriesgado pronunciarse sobre el desequilibrio. Lo que sí hay y cada vez más en profundidad, son estudios encaminados a relacionar determinados patrones de flora intestinal con mayor riesgo de desarrollo de algunas enfermedades... o por el contrario, asociar determinada presencia de cepas de bacterias con efectos beneficiosos. Pero es algo que está en fase de investigación, muy prometedor, pero todavía con muchos claroscuros que propician airear resultados preliminares y todavía no sólidamente contrastados.

Todavia no están disponibles tal como usted lo comenta. La única prueba en este sentido es realizar un coprocultivo y ver si se trata de flora normal o patológica. Todavía son pruebas limitadas con sois de investigación únicamente.