Tengo un bebé de casi 3 meses, lactancia materna exclusiva, que en las ultimas dos semanas ha cambia

Tengo un bebé de casi 3 meses, lactancia materna exclusiva, que en las ultimas dos semanas ha cambiado su ritmo intestinal.. ha pasado de 2-3 deposiciones al día, a una cada 3-4 días. Por lo general parece que se encuentra bien, pero al final ya se muestra muy incómodo, y ya la ultima vez hacia 4 días y tuve que ponerle un microenema (Melilax) recetado por la pediatra, a quien ya le comenté la situación y dijo que era "normal". Pero no me quedo tranquila, porque además hay otra cosa que nunca le había pasado y es que sus gases y heces huelen muy muy mal... no se a que puede deberse pero siento que algo no está bien. No quiero recurrir más a los microenemas pero es que lo pasa tan mal... ni masajes ni nada funciona.