Tengo una bebé de 6 meses que ya le tocan sus vacunas, pero esta enferma y le recetaron amoxicilina

Depende del tipo de proceso para que le hayan recetado el antibiótico. En general es necesario ser prudentes con otro tipo de medicamentos que influyen en la respuesta inmunitaria, como los corticoides.

Si le han recetado un antibiótico, seguramente es porque la niña sufre un proceso agudo de probable etiología bacteriana, que suelen ser febriles. En este caso lo mejor será posponer la vacunación hasta la total resolución del proceso.