Una faringitis gonocócica asintomática no tratada puede diseminarse al aparato urinario? Si es así,

No le dé demasiadas vueltas: el gonococo en faringe se detecta por un frotis y basta con una tinción de Gram y a veces un cultivo (por hacer antibiograma). Pero pensar hacia dónde se disemina o si se puede detectar por pruebas más caras y sofisticadas como una PCR en orina es como oír galopes y pensar en cebras en lugar de caballos.

lo mas adecuado es realizar un frotis de exudado faringeo ,esperar resultados e instaurar tratamiento

Seria completamente excepcional. Si tiene el gonococo necesitaría tratamiento que resultaría eficaz en diversas localizaciones