Me he hecho una citología por primera vez en mi vida (tengo 27 años) y no entiendo qué quiere decir

No leas Internet, el Dr. Google no existe.
Cuando se hace una citología se valoran las células para ver si hay alteraciones sospechosas: se ve la flora y, dependiendo del momento del ciclo en que lo hayas efectuado, se ve el nivel hormonal si coincide con el ciclo.
Hipotrófico a los 27 años es normal al principio o final del ciclo.

En una citología valoramos la respuesta de las células epiteliales (que es lo que se toma en la citología cervical) a las hormonas del ciclo. Los estrógenos suben en la primera mitad del ciclo para dar paso a la progesterona en la segunda parte del ciclo. El trofismo lo dan los estrógenos por lo que al principio y al final del ciclo las células pueden aparecer hipotroficas. También en mujeres embarazadas los vemos hipotroficas porque en éstas la hormona predominante es la progesterona.
En principio el tener un frotis hipotrófico no tiene por que dificultar el embarazo.

Se hace referencia a un estado madurativo del epitelio que, si bien es dependiente del estado hormonal, no tiene por qué ser interpretado como de tipo menopáusico. El nivel de hormonas fluctúa y así lo hace también la maduración epitelial. Estados de hipotrofia puntuales o transitorios no tienen en principio trascendencia. Si estos se prolongan habría que recurrir a estudios analíticos que demostraran la presencia o ausencia de alteraciones hormonales.