Mi bebé de casi 6 meses al despertarse, asustado, pone como los ojos para arriba, ¿es normal?

No sé contestarte directamente a tu pregunta, pero me parece lo más importante que estés tranquila en cuanto a ello. Si todo lo demás va bien tal vez no debieras preocuparte.

No es preocupante pero coméntaselo a tu pediatra que le solicite un EEG.

Puede ser una respuesta adecuada ante el miedo.
Algo sentido del exterior, o desde el interior, perturba al niño. Eso le molesta, le hace sentirse mal, y se despliega el miedo. Con su inmadurez sensoriomotora poco puede hacer para defenderse: dirigir la mirada, espasmos, llorar, etc. Es la madre, o sustituto, quien tranquiliza al niño.
En su caso, los dos están asustados, sin entender lo que pasa. Su miedo, el niño lo siente, lo registra como algo desagradable, y aumenta la tensión.
El bebé es una antena para recibir el estado emocional.
Coménteselo a su médico. Si es primeriza, estará más sensible a lo que observe y se preocupará más de lo necesario.
Cuando la madre tiene dificultades personales (inseguridad, miedos, etc.), un apoyo psicoterapéutico, favorece también el desarrollo madurativo del hijo. Pues, en el primer año de vida, ella es principalmente la que va a traducir, dar sentido y poner en palabras lo que pasa, calmar o estimular a su bebé, a través de sus cuidados y su cariño.

Los bebes, tienen la cualidad de que producen en los auxiliares parentales todo tipo de emociones, de lo que ellos son completamente inconscientes, afortunadamente para todos.
El auxiliar materno recibe en primera persona las proyecciones de las necesidades del bebe, tanto las que tienen que ver con los cuidados de la necesidades más primarias; comida, etc. como aquellas que se refieren a las emociones de auxilio en las sensaciones arcaicas, placenteras igualmente, el bebe experimenta situaciones de amparo o de desamparo, que requieren una repuesta por parte del auxiliar parental que le permita una mínima contención.
El adulto se convierte en el traductor de emociones primeras que de otra manera no podría representarse y esos primero momentos inaugurales y fundantes de su organización psíquica, colocan a los padres en situaciones complejas pero necesarias para la articulación adecuada de ofrecer los cuidados más primarios de la necesidad y emocionales.

Puede ser del todo normal, pero sería conveniente acudir a un pediatra y comentarlo, sin duda podrá orientarte muy bien.