Soy practicante de Mtb, a lo largo de este año he participado en varias pruebas de maratón. La cuestión

Desde el ámbito de la fisioterapia, sería conveniente valorar el estado de la charnela lumbosacra, pues es frecuente que una mala posición durante la carrera, es decir, una deficiente técnica, pueda provocar un aumento de compresión en dicha zona. Y provocar dolores irradiados a los miembros inferiores.
También debe valorar el estado de sus zapatillas, cuya vida útil está en torno a los 1000 kms de uso.

Le recomiendo que visite a un médico del deporte y que le realicen un profundo estudio de su estado físico. A partir de ahí, lo ideal es que realice su actividad bajo el control de un preparador físico.
Como norma general, aunque no le va a gustar, el reposo temporal, es una buena pauta en estos casos.
Pruebe descansar o cambiar de deporte durante un par de meses.

Debería hacerse un estudio por un médico del deporte: posteriormente, en ausencia de alteraciones valore un estudio biomecánico de su postura en la bicicleta que mesure además la fuerza de los músculos de sus piernas. Modificando su postura en la bicicleta, fortaleciendo ciertas estructuras y estirando bien se podría solucionar. Suerte.

Sería necesario exploración y pruebas complementarias para ir descartando cosas. Haría una analítica completa, ENG, Eco doppler y medición de presiones intracompartimentales en miembros inferiores. Saludos