Hola ! La hora de la toma no modifica la carga viral. Esta elevación puede deberse a varios factores, entre ellos resistencia al fármaco. Debes acudir a tu médico Especialista tratante.
Efectivamente le puede dar esta sintomatología los primeros días. No creo de todas formas que se encuentre más de un mes. Si continúa, acuda a su médico para cambiar la medicación.